Unionistas CF ha apostado desde su nacimiento por la cantera. Actualmente, el club cuenta con una veintena de equipos y en las 3 categorías en las que existe categoría regional -juvenil, cadete e infantil- hay un equipo de Unionistas CF jugando ante equipos de Castilla y León.
La entidad no nutre al primer equipo con el dinero de su cantera, sino todo lo contrario. Unionistas CF está muy orgulloso de invertir en ella: todas las temporadas el capítulo de gastos es superior al de ingresos e este apartado.